深圳港先后建成蛇口、赤湾、妈湾、东角头、盐田、福永、下洞、沙渔涌、内河九个港区。
截止2003年底，共建成500吨级以上各类泊位136个，其中万吨级以上泊位47个;经营性泊位86个，其中万吨级以上经营性泊位39个;集装箱专用泊位14个;货主码头泊位9个，其中万吨级以上泊位3个;客运轮渡泊位18个;非生产性泊位23个。形成年综合总吞吐能力7 313.4万吨，其中集装箱吞吐能力495万标准箱(含多用途泊位集装箱能力)。
1、盐田国际集装箱码头有限公司，94年开始运营，仍在扩建中，预计2010年全面完工。全面完工后将拥有19个可靠泊万吨专业船舶的泊位。年吞吐量可达千万标准箱。
2、赤湾集装箱码头有限公司，89年开始建设，05年完工，拥有泊位13个，均可以操作最新式的集装箱船舶，吞吐能力在800万标准箱左右。
3、蛇口集装箱码头有限公司，90年开工建设，08年全面结束，9个泊位，年处理集装箱6百万标准箱。